Sim. Um site bem estruturado facilita rastreamento, indexação, compreensão do conteúdo e experiência do usuário, todos elementos importantes para presença orgânica.
O projeto pode facilitar esse trabalho ao organizar páginas, títulos, navegação, performance, semântica e dados de forma compreensível para pessoas e mecanismos de busca. Também pode eliminar limitações técnicas que impedem rastreamento ou tornam a manutenção de conteúdo difícil.
Mas um site tecnicamente bom não cria autoridade e relevância sozinho. A empresa ainda precisa oferecer conteúdo coerente com o que o público procura e, dependendo do mercado, construir presença e referências ao longo do tempo. O site é a infraestrutura sobre a qual o SEO pode trabalhar melhor.